66分基因家族泛癌分析实验验证,投稿

大家好,今天要和大家分享的是年8月发表的一篇文章:“Pan-CancerAnalysisofPrognosticandImmuneInfiltratesforCXCs”。

CXCs是调节炎症和肿瘤转移的重要基因。在本项研究中,作者首先利用多个数据集对CXCs进行了全面的生物信息学分析,包括该基因在泛癌中的表达、预后、免疫浸润、遗传变化和功能分析。随后借助Amadis数据库中的网络分析工具研究肠道菌群对CXCs表达的调控,发现CXCL8和具核梭杆菌(F.nucleatum)和人类疾病(包括炎症性肠病和结肠癌)之间可能存在关联。为了验证这种关联,作者使用氧化偶氮甲烷(AOM)/葡聚糖硫酸钠(DSS)诱导的结肠炎相关癌症(CAC)小鼠模型验证肠道细菌失调会影响CXC表达。总之,本研究阐明了CXCs在癌症中的功能,并为乳腺癌(BRCA)、结肠癌(COAD)和胰腺癌(PDAC)的预后和免疫浸润提供了新的见解,表明肠道菌群可能通过CXCs影响疾病进展。

发表杂志:Cancers(Basel).

本文从投稿到接收不到两个月

影响因子:6.

研究背景

肿瘤转移是与癌症预后不良相关的重要因素,主要取决于肿瘤微环境。肿瘤微环境是一个由肿瘤细胞、淋巴细胞、癌症相关成纤维细胞和其他细胞组成的复杂系统,这些细胞分泌细胞因子,包括CXC,可促进肿瘤细胞的生长和肿瘤血管生成,并有助于肿瘤转移。CXC趋化因子(C对应于半胱氨酸,X表示任何氨基酸)是趋化因子的一个亚家族。一般来说,血管生成活性通常被ELR阳性趋化因子增强,而被ELR阴性趋化因子抑制。ELR+CXC趋化因子包括CXCL1-3、CXCL5-8和CXCL17,ELR趋化因子包括CXCL4、CXCL9-14和CXCL16。最新研究表明,CXC趋化因子可能成为评估肿瘤预后的潜在生物标志物,并可能成为新的治疗靶点。

分析解读:

CXCs在泛癌中的表达

①分析CXC在多种癌症组织与相应正常组织中的差异表达水平。

②分析乳腺癌、结肠癌和胰腺癌单细胞测序数据集中16个基因的亚群分布。

结果:

下图:CXCs在20种不同癌症中的转录表达

下表:CXCs在On


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