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蛋白质含量鉴定是蛋白质组学研究中的重要内容，也是进行某些后续分析的前提，如进行差异蛋白的筛选前就必须对蛋白的含量进行精确的鉴定。目前鉴定蛋白质含量的方法主要有经典的凯氏定氮法、考马斯亮蓝法、双缩脲法、紫外吸收法以及新发展起来的基于质谱的方法等。
SDS-PAGE十二烷基磺酸钠聚丙烯酰胺凝胶电泳是基于蛋白质分子质量进行蛋白分离的分析技术。根据蛋白质的分子质量将其分离为不同的蛋白条带，常用于蛋白质的分子质量和纯度鉴定。另外，基于蛋白质电泳条带的宽度可以对蛋白质的含量多少进行粗略的估计，若蛋白条带较宽、颜色较深，则说明该蛋白的量较多；反之，则说明其含量较少。SDS-PAGE只能对蛋白含量的多少进行粗略的估计，不能计算出其准确的值，若要精确计算某个蛋白质的含量，需要将蛋白胶条中包含的蛋白质回收，利用其它技术如质谱技术进行后续精确鉴定。